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    CRISPR : Methods and Protocols (2015)
    New York, NY :Springer New York :
    Details
    UID:
    almahu_9949251306102882
    Format: 1 online resource (XIV, 366 p. 63 illus., 37 illus. in color.)
    Edition: 1st ed. 2015.
    ISBN: 1-4939-2687-X
    Series Statement: Methods in Molecular Biology, 1311
    Content: This volume presents a list of cutting-edge protocols for the study of CRISPR-Cas defense systems and their applications at the genomic, genetic, biochemical and structural levels. CRISPR: Methods and Protocols guides readers through techniques that have been developed specifically for the analysis of CRISPR-Cas and techniques adapted from standard protocols of DNA, RNA and protein biology. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.   Authoritative and cutting-edge, CRISPR: Methods and Protocols provides a broad list of tools and techniques to study the interdisciplinary aspects of the prokaryotic CRISPR-Cas defense systems.
    Note: Bibliographic Level Mode of Issuance: Monograph , Investigating CRISPR RNA Biogenesis and Function using RNA-seq -- In vitro Co-reconstitution of Cas Protein Complexes -- Analysis of CRISPR pre-crRNA Cleavage -- Annotation and Classification of CRISPR-Cas Systems -- Computational Detection of CRISPR/crRNA Targets -- High-throughput CRISPR typing of Mycobacterium tuberculosis Complex and Salmonella enterica Serotype Typhimurium -- Spacer-based Macroarrays for CRISPR Genotyping -- Analysis of crRNA using Liquid Chromatography Electrospray Ionisation Mass Spectrometry (LC ESI MS) -- Rapid Multiplex Creation of Escherichia coli Strains Capable of Interfering with Phage Infection through CRISPR -- Exploring CRISPR Interference by Transformation with Plasmid Mixtures: Identification Of Target Interference Motifs in Escherichia coli -- Electrophoretic Mobility Shift Assay of DNA and CRISPR-Cas Ribonucleoprotein Complexes -- Expression and Purification of the CMR (Type III-B) Complex in Sulfolobus solfataricus -- Procedures for Generating CRISPR Mutants With Novel Spacers Acquired from Viruses Or Plasmids -- Archaeal Viruses of the Sulfolobales: Isolation, Infection, and CRISPR Spacer Acquisition -- Using the CRISPR-Cas system to Positively Select Mutants In Genes Essential for its Functionl -- Analysis of Nuclease Activity of Cas1 Proteins Against Complex DNA Substrates -- Characterizing Metal-Dependent Nucleases of CRISPR-Cas prokaryotic Adaptive Immunity Systems -- Cas3 Nuclease-Helicase Activity Assays -- Chemical and Enzymatic Footprint Analyses of R-loop Formation by Cascade-crRNA Complex -- Creation and Analysis of a Virome: Using CRISPR Spacers -- Targeted Mutagenesis in Zebrafish using CRISPR RNA-guided Nucleases -- Precise Genome Editing of Drosophila with CRISPR RNA-guided Cas9 -- Targeted Transcriptional Repression in Bacteria using CRISPR Interference (CRISPRi). , English
    Additional Edition: ISBN 1-4939-2686-1
    Language: English
    DOI: 10.1007/978-1-4939-2687-9
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    Le peuple du rivage : Le littoral nord de la Bretagne au XVIIIe siècle (2013)
    [Erscheinungsort nicht ermittelbar] : Presses universitaires de Rennes
    Details
    UID:
    gbv_1778665829
    Format: 1 Online-Ressource
    ISBN: 9782753569126
    Content: Partir à la recherche des sociétés littorales, sur les côtes nord de la Bretagne, au XVIIIe siècle, suppose d’abandonner les représentations qui valorisent tant le littoral aujourd’hui : jusqu’au début du XIXe siècle, le « désir collectif du rivage » n’en est encore qu’à ses balbutiements. Dans une société où prédomine la terre, l’attractivité de la mer est loin d’être une évidence, même sur le littoral. Cet ouvrage est consacré à cette « maritimité première manière » et aux relations complexes qu’entretient le peuple du rivage avec la mer, la terre et l’estran. Dans cette perspective, se pose le problème de « l’appel du large » qui pousserait de manière irrésistible les Bretons à prendre la mer. Au-delà, cela engage à s’interroger sur les spécificités des sociétés littorales, du Mont-Saint-Michel jusqu’à Brest, qui se distingueraient des sociétés de l’intérieur, celles de l’Argoat, tournées vers la terre et ignorantes des choses de la mer. Au fil de l’étude se révèle la dimension que prennent les côtes nord de la Bretagne au XVIIIe siècle : espace approprié, vécu et exploité, à la charnière entre l’horizon maritime et l’horizon terrestre. Elles font figure d’enjeu au XVIIIe siècle tant il devient essentiel de préserver leurs ressources, de protéger leurs habitants des dangers véhiculés par la mer et de consolider les droits du littoral, niés dans les seigneuries agro-maritimes. Soit autant d’occasions pour le pouvoir royal d’affirmer son autorité dans un finisterre redécouvert à la fin du XVIIe siècle alors que se profile la « Seconde Guerre de Cent ans ». « Ceux qui fréquentent la mer », les marins des côtes nord de la Bretagne, sont devenus un rouage déterminant dans la lutte contre l’hégémonie maritime anglaise. Si tous sont soumis aux rythmes de l’océan, l’expérience de la mer diffère selon les trajectoires individuelles. Une fois débarqués, ils se fondent parmi les gens du littoral, à l’image de leurs femmes, ancrées à terre. Marins par intermittence et terriens dans l’âme, ils déploient, avec leur famille, des stratégies de (sur)vie pour faire face à l’absence, inhérente aux activités maritimes. Elles contribuent à brouiller les identités professionnelles et rendent perméable la séparation entre le monde des terriens et celui des marins. S’esquissent alors les contours de sociétés complexes et originales, ouvertes sur la terre et la mer selon de multiples déclinaisons, mais qui restent fondamentalement des sociétés de l’Ancien Régime
    Note: French
    Language: French
    URL: kostenfrei
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  • 3
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    Le temps suspendu (2022)
    Pessac : Maison des Sciences de l'homme d'Aquitaine
    Details
    UID:
    gbv_1869166612
    Format: 1 Online-Ressource (361 p.)
    ISBN: 9782858926374 , 9782858926381
    Series Statement: PrimaLun@ 12
    Content: In Raymond Radiguet’s works, women confronted with the absence of their spouse are a recurrent literary figure. Between the virtuous wife set up as a model and the adulterous woman who is a source of scandal, there are many nuances that encourage us to go beyond this reductive approach. Suspended time’ is precisely a window on the history of married women confronted with the long-term absence of a husband, considering them in their full agentivity and not as victims undergoing the throes of separation. The question of the autonomy and independence of wives in Western societies, which have long been patriarchal, is therefore at the heart of this book. Indeed, the departure of men, whether they are at war, at sea or elsewhere, offers the possibility of partially bypassing the “silences of history” with regard to women and of observing them, on a daily basis, in their confrontation with the absence of the other. This collection of essays is firmly rooted in the history of the family and the history of gender, and offers twenty-four contributions whose approaches alternate between individual trajectories – so many female experiences of absence – and more general perspectives, from Greek antiquity, through Renaissance Italy and revolutionary France, to contemporary Quebec
    Note: French , English
    Language: Undetermined
    URL: kostenfrei
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  • 4
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    Les femmes et la mer à l'époque moderne (2018)
    Rennes : Presses universitaires de Rennes
    Details
    UID:
    gbv_1832222934
    Format: 1 Online-Ressource (266 p.)
    ISBN: 9782753588882 , 9782753574557
    Series Statement: Histoire
    Content: La mer constitue le personnage principal de chacun des tableaux des « Ports de France » réalisés par Joseph Vernet entre 1753 et 1765. Le regard porte en premier lieu sur les navires amarrés, perçoit ensuite l'intense activité des quais, puis distingue des individus parmi lesquels... des femmes, bien présentes dans un monde maritime traditionnellement masculin. Cet ouvrage entend attirer l'attention sur les multiples déclinaisons du rapport qu'entretiennent les femmes avec la mer, en variant points de vue et échelles d'observation. Il rassemble des travaux jusque-là dispersés, en histoire mais aussi en littérature et en histoire de l'art, pour une époque moderne débordant sur le xixe siècle et qui s'inscrit dans une perspective européenne. L'histoire maritime et littorale d'un côté et de l'autre, l'histoire des femmes et du genre : passionnant croisement des sources ô combien fécond pour qui se donne la peine de revisiter les archives, bien souvent de lire entre les lignes ou encore d'interpréter les silences. Les quinze contributions réunies ici en témoignent. Faire face à l'absence et savoir gérer celle-ci, vivre de la mer, approcher l'océan, le contempler et parfois s'en désintéresser : hors des clichés, cette union n'est pas contre nature
    Note: French
    Language: Undetermined
    URL: kostenfrei
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    Les femmes et la mer à l’époque moderne / (2022)
    Rennes :Presses universitaires de Rennes,
    Details
    UID:
    almahu_9949427705402882
    Format: 1 online resource (266 p.)
    ISBN: 2-7535-8888-0
    Series Statement: Histoire
    Content: La mer constitue le personnage principal de chacun des tableaux des « Ports de France » réalisés par Joseph Vernet entre 1753 et 1765. Le regard porte en premier lieu sur les navires amarrés, perçoit ensuite l’intense activité des quais, puis distingue des individus parmi lesquels… des femmes, bien présentes dans un monde maritime traditionnellement masculin. Cet ouvrage entend attirer l’attention sur les multiples déclinaisons du rapport qu’entretiennent les femmes avec la mer, en variant points de vue et échelles d’observation. Il rassemble des travaux jusque-là dispersés, en histoire mais aussi en littérature et en histoire de l’art, pour une époque moderne débordant sur le xixe siècle et qui s’inscrit dans une perspective européenne. L’histoire maritime et littorale d’un côté et de l’autre, l’histoire des femmes et du genre : passionnant croisement des sources ô combien fécond pour qui se donne la peine de revisiter les archives, bien souvent de lire entre les lignes ou encore d’interpréter les silences. Les quinze contributions réunies ici en témoignent. Faire face à l’absence et savoir gérer celle-ci, vivre de la mer, approcher l’océan, le contempler et parfois s’en désintéresser : hors des clichés, cette union n’est pas contre nature.
    Note: French
    Additional Edition: ISBN 2-7535-7455-3
    Language: French
    DOI: 10.4000/books.pur.167057
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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    Les femmes et la mer à l’époque moderne / (2022)
    Rennes :Presses universitaires de Rennes,
    Details
    UID:
    edoccha_9960962343502883
    Format: 1 online resource (266 p.)
    ISBN: 2-7535-8888-0
    Series Statement: Histoire
    Content: La mer constitue le personnage principal de chacun des tableaux des « Ports de France » réalisés par Joseph Vernet entre 1753 et 1765. Le regard porte en premier lieu sur les navires amarrés, perçoit ensuite l’intense activité des quais, puis distingue des individus parmi lesquels… des femmes, bien présentes dans un monde maritime traditionnellement masculin. Cet ouvrage entend attirer l’attention sur les multiples déclinaisons du rapport qu’entretiennent les femmes avec la mer, en variant points de vue et échelles d’observation. Il rassemble des travaux jusque-là dispersés, en histoire mais aussi en littérature et en histoire de l’art, pour une époque moderne débordant sur le xixe siècle et qui s’inscrit dans une perspective européenne. L’histoire maritime et littorale d’un côté et de l’autre, l’histoire des femmes et du genre : passionnant croisement des sources ô combien fécond pour qui se donne la peine de revisiter les archives, bien souvent de lire entre les lignes ou encore d’interpréter les silences. Les quinze contributions réunies ici en témoignent. Faire face à l’absence et savoir gérer celle-ci, vivre de la mer, approcher l’océan, le contempler et parfois s’en désintéresser : hors des clichés, cette union n’est pas contre nature.
    Note: French
    Additional Edition: ISBN 2-7535-7455-3
    Language: French
    DOI: 10.4000/books.pur.167057
    Library Location Call Number Volume/Issue/Year Availability
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    Les femmes et la mer à l’époque moderne / (2022)
    Rennes :Presses universitaires de Rennes,
    Details
    UID:
    edocfu_9960962343502883
    Format: 1 online resource (266 p.)
    ISBN: 2-7535-8888-0
    Series Statement: Histoire
    Content: La mer constitue le personnage principal de chacun des tableaux des « Ports de France » réalisés par Joseph Vernet entre 1753 et 1765. Le regard porte en premier lieu sur les navires amarrés, perçoit ensuite l’intense activité des quais, puis distingue des individus parmi lesquels… des femmes, bien présentes dans un monde maritime traditionnellement masculin. Cet ouvrage entend attirer l’attention sur les multiples déclinaisons du rapport qu’entretiennent les femmes avec la mer, en variant points de vue et échelles d’observation. Il rassemble des travaux jusque-là dispersés, en histoire mais aussi en littérature et en histoire de l’art, pour une époque moderne débordant sur le xixe siècle et qui s’inscrit dans une perspective européenne. L’histoire maritime et littorale d’un côté et de l’autre, l’histoire des femmes et du genre : passionnant croisement des sources ô combien fécond pour qui se donne la peine de revisiter les archives, bien souvent de lire entre les lignes ou encore d’interpréter les silences. Les quinze contributions réunies ici en témoignent. Faire face à l’absence et savoir gérer celle-ci, vivre de la mer, approcher l’océan, le contempler et parfois s’en désintéresser : hors des clichés, cette union n’est pas contre nature.
    Note: French
    Additional Edition: ISBN 2-7535-7455-3
    Language: French
    DOI: 10.4000/books.pur.167057
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    FU Berlin
  • 8
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    Les femmes et la mer à l'époque moderne (2018)
    Rennes : Presses universitaires de Rennes
    Details
    UID:
    gbv_1688949763
    Format: 264 Seiten , Illustrationen, Karten , 24 cm
    ISBN: 9782753574557 , 2753574553 , 9782753574854 , 2753574855
    Series Statement: Collection "Histoire"
    Content: Pt. 1.Faire face à l'absence --La vie fragile des femmes de marins en Provence au XVIIIe siècle --Gérer l'absence par procurations. La femme et la mer en Provence au XVIIIe siècle --Autour de Marie-Jacquette Pignot, une femme de marin au XVIIIe siècle --Épouses, filles et soeurs de marins néerlandais à l'époque moderne --Pt. 2.Vivre de la mer --Les femmes dans l'économie maritime à l'époque moderne --Les femmes et leurs activités liées à la mer. Réflexions à partir du littoral atlantique français à l'époque moderne --Pinceauteuses, fileuses et tailleuses... Les ouvrières nantaises au XVIIIe siècle : importance et mutation du travail féminin dans une grande cité portuaire et industrielle --Des jupons dans l'arsenal de Brest. Genre et port de guerre à la fin de l'Ancien Régime --Pêcheuses, matelotes et bourgeoises maritimes des villages littoraux saintongeais (XVIIe -XIXe siècle) --Les femmes, le travail et la mer au XVIIIe siècle dans les îles Shetland --Pt. 3.Raconter les femmes et la mer --Deux Allemandes et une Anglaise face à leur "désir de rivage" Sophie von La Roche, Johanna Schopenhauer et Mrs Cradock voyagent en France à la fin de l'Ancien Régime --La mer dans les journaux de voyage en Europe de jeunes femmes russes (fin XVIIIe-début XIXe siècle) --Une femme à bord parmi des hommes. Le voyage transatlantique de Flora Tristan (1833), éveil d'une conscience sociale --Femmes de marins femmes de chagrin? Les femmes de marins dans la littérature du XIXe siècle --Joseph Vernet, la mer et les femmes.
    Content: "La mer constitue le personnage principal de chacun des tableaux des "Ports de France" réalisés par Joseph Vernet entre 1753 et 1765. Le regard porte en premier lieu sur les navires amarrés, perçoit ensuite l'intense activité des quais, puis distingue des individus parmi lesquels... des femmes, bien présentes dans un monde maritime traditionnellement masculin. Cet ouvrage entend attirer l'attention sur les multiples déclinaisons du rapport qu'entretiennent les femmes avec la mer, en variant points de vue et échelles d'observation. Il rassemble des travaux jusque-là dispersés, en histoire mais aussi en littérature et en histoire de l'art, pour une époque moderne débordant sur le XIXe siècle et qui s'inscrit dans une perspective européenne. L'histoire maritime et littorale d'un côté et de l'autre, l'histoire des femmes et du genre : passionnant croisement des sources ô combien fécond pour qui se donne la peine de revisiter les archives, bien souvent de lire entre les lignes ou encore d'interpréter les silences. Les quinze contributions réunies ici en témoignent. Faire face à l'absence et savoir gérer celle-ci, vivre de la mer, approcher l'océan, le contempler et parfois s'en désintéresser : hors des clichés, cette union n'est pas contre nature."--Page 4 of cover
    Note: Includes bibliographical references
    Language: French
    Keywords: Frankreich ; Meer ; Küstengebiet ; Schifffahrt ; Frau ; Geschichte 1700-1900 ; Konferenzschrift
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  • 9
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    Survival Strategies of Streptococcus pyogenes in Response to Phage Infection (2021)
    Berlin : Humboldt-Universität zu Berlin
    Details
    UID:
    edochu_18452_23657
    Format: 1 Online-Ressource (22 Seiten)
    Content: Bacteriophages exert strong evolutionary pressure on their microbial hosts. In their lytic lifecycle, complete bacterial subpopulations are utilized as hosts for bacteriophage replication. However, during their lysogenic lifecycle, bacteriophages can integrate into the host chromosome and alter the host’s genomic make-up, possibly resulting in evolutionary important adjustments. Not surprisingly, bacteria have evolved sophisticated immune systems to protect against phage infection. Streptococcus pyogenes isolates are frequently lysogenic and their prophages have been shown to be major contributors to the virulence of this pathogen. Most S. pyogenes phage research has focused on genomic prophages in relation to virulence, but little is known about the defensive arsenal of S. pyogenes against lytic phage infection. Here, we characterized Phage A1, an S. pyogenes bacteriophage, and investigated several mechanisms that S. pyogenes utilizes to protect itself against phage predation. We show that Phage A1 belongs to the Siphoviridae family and contains a circular double-stranded DNA genome that follows a modular organization described for other streptococcal phages. After infection, the Phage A1 genome can be detected in isolated S. pyogenes survivor strains, which enables the survival of the bacterial host and Phage A1 resistance. Furthermore, we demonstrate that the type II-A CRISPR-Cas system of S. pyogenes acquires new spacers upon phage infection, which are increasingly detectable in the absence of a capsule. Lastly, we show that S. pyogenes produces membrane vesicles that bind to phages, thereby limiting the pool of phages available for infection. Altogether, this work provides novel insight into survival strategies employed by S. pyogenes to combat phage predation.
    Content: Peer Reviewed
    In: Basel : MDPI, 13,4
    Language: English
    DOI: 10.18452/22990
    DOI: 10.3390/v13040612
    URN: urn:nbn:de:kobv:11-110-18452/23657-0
    URL: Volltext  (kostenfrei)
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    HU Berlin
  • 10
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    Expanding the genetic toolbox for the obligate human pathogen Streptococcus pyogenes (2024)
    Berlin : Humboldt-Universität zu Berlin
    Details
    UID:
    edochu_18452_29694
    Format: 1 Online-Ressource (23 Seiten)
    Content: Genetic tools form the basis for the study of molecular mechanisms. Despite many recent advances in the field of genetic engineering in bacteria, genetic toolsets remain scarce for non-model organisms, such as the obligatory human pathogen Streptococcus pyogenes. To overcome this limitation and enable the straightforward investigation of gene functions in S. pyogenes, we have developed a comprehensive genetic toolset. By adapting and combining different tools previously applied in other Gram-positive bacteria, we have created new replicative and integrative plasmids for gene expression and genetic manipulation, constitutive and inducible promoters as well as fluorescence reporters for S. pyogenes. The new replicative plasmids feature low- and high-copy replicons combined with different resistance cassettes and a standardized multiple cloning site for rapid cloning procedures. We designed site-specific integrative plasmids and verified their integration by nanopore sequencing. To minimize the effect of plasmid integration on bacterial physiology, we screened publicly available RNA-sequencing datasets for transcriptionally silent sites. We validated this approach by designing the integrative plasmid pSpy0K6 targeting the transcriptionally silent gene SPy_1078. Analysis of the activity of different constitutive promoters indicated a wide variety of strengths, with the lactococcal promoter P23 showing the strongest activity and the synthetic promoter PxylS2 showing the weakest activity. Further, we assessed the functionality of three inducible regulatory elements including a zinc- and an IPTG-inducible promoter as well as an erythromycin-inducible riboswitch that showed low-to-no background expression and high inducibility. Additionally, we demonstrated the applicability of two codon-optimized fluorescent proteins, mNeongreen and mKate2, as reporters in S. pyogenes. We therefore adapted the chemically defined medium called RPMI4Spy that showed reduced autofluorescence and enabled efficient signal detection in plate reader assays and fluorescence microscopy. Finally, we developed a plasmid-based system for genome engineering in S. pyogenes featuring the counterselection marker pheS*, which enabled the scarless deletion of the sagB gene. This new toolbox simplifies previously laborious genetic manipulation procedures and lays the foundation for new methodologies to study gene functions in S. pyogenes, leading to a better understanding of its virulence mechanisms and physiology.
    Content: Peer Reviewed
    In: Lausanne : Frontiers Media, 12
    Language: English
    DOI: 10.18452/29078
    DOI: 10.3389/fbioe.2024.1395659
    URN: urn:nbn:de:kobv:11-110-18452/29694-8
    URL: Volltext  (kostenfrei)
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