883419408

Systems biology : simulation of dynamic network states / Bernhard Ø. Palsson

Englisch

Cambridge : Cambridge University Press, 2011

1 Online-Ressource (332 p.)

Title from publisher's bibliographic system (viewed on 05 Oct 2015)

Erscheint auch als: Druck-Ausgabe- Palsson, Bernhard O. *1957-*: Systems biology. - Cambridge [u.a.] : Cambridge Univ. Press, 2011. - XIII, 317 S.

978-0-511-73617-9 : ebook

Weitere Ausgaben: 978-1-107-00159-6 (Druckausgabe) : hardback

DOI: 10.1017/CBO9780511736179

*Systembiologie / Bioinformatik

*Computational biology ; Genomics ; Bioinformatics ; Genomics ; Bioinformatics ; Computational biology ; Systems biology

*Computational biology ; Genomics ; Bioinformatics ; Systems biology ; Computational biology ; Genomics ; Bioinformatics

Klassifikation der Library of Congress: QH324.2

Dewey Dezimal-Klassifikation: 572.80285;

Regensburger Verbund-Klassifikation: WD 9200: W Biologie / WD Biophysik, Biochemie, Physiologische Chemie / WD 4550-WD 9400 Spezielle Biochemie und Biophysik / WD 9000 Theoretische Biologie und Systemforschung insgesamt / Systemtheorie und biologische Modelle

Regensburger Verbund-Klassifikation: WC 7700: W Biologie / WC Methoden / WC 7000 Biometrie, Biomathematik / Bioinformatik

Regensburger Verbund-Klassifikation: ST 640: SQ-SU Informatik / ST Monografien / ST 320-ST 690 Einzelne Anwendungen der Datenverarbeitung / ST 600-ST 690 Datenverarbeitung in Anwendungsgebieten / Medizin

Regensburger Verbund-Klassifikation: SK 990: SA-SP Mathematik / SK Monografien / Mathematik in anderen Wissenschaften

Regensburger Verbund-Klassifikation: SK 950: SA-SP Mathematik / SK Monografien / Mathematische Methoden in den Naturwissenschaften

Mathematics Subject Classification: *92-02

Mathematics Subject Classification: 92B20

Mathematics Subject Classification: 92C42

Mathematics Subject Classification: 92C30

Mathematics Subject Classification: 92C45

Mathematics Subject Classification: 00A72

Biophysical models have been used in biology for decades, but they have been limited in scope and size. In this book, Bernhard Ø. Palsson shows how network reconstructions that are based on genomic and bibliomic data, and take the form of established stoichiometric matrices, can be converted into dynamic models using metabolomic and fluxomic data. The Mass Action Stoichiometric Simulation (MASS) procedure can be used for any cellular process for which data is available and allows a scalable step-by-step approach to the practical construction of network models. Specifically, it can treat integrated processes that need explicit accounting of small molecules and protein, which allows simulation at the molecular level. The material has been class-tested by the author at both the undergraduate and graduate level. All computations in the text are available online in MATLAB and MATHEMATICA® workbooks, allowing hands-on practice with the material

https://zbmath.org/?q=an:1286.92005 [Zentralblatt MATH]

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